Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-22■■■■■ 27.1
RPS3P23396 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.854e-15■■■■■ 27.1
RPS3P23396 HIST1H4H-202ENST00000634560 1034 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.854e-15■■■■■ 27.1
RPS3P23396 HIST1H4H-201ENST00000377727 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-15■■■■■ 27.1
RPS3P23396 HIST1H4H-203ENST00000634956 2163 ntTSL 57.72□□□□□ -1.174e-15■■■■■ 27.1
RPS3P23396 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-17■■■■■ 27.1
RPS3P23396 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.694e-8■■■■■ 27.1
RPS3P23396 HMBS-223ENST00000545901 581 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.358e-9■■■■■ 27.1
RPS3P23396 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-85■■■■■ 27.1
RPS3P23396 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-85■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-217ENST00000484181 1683 ntTSL 316.48■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.098e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 27.1
RPS3P23396 CCT7-211ENST00000480489 527 ntTSL 219.61■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 27
RPS3P23396 CCT7-208ENST00000471927 556 ntTSL 416.33■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 27
RPS3P23396 IDH3B-211ENST00000492240 964 ntTSL 59.46□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 27
RPS3P23396 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 COASY-209ENST00000588353 387 ntTSL 315.79■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 COASY-214ENST00000591779 994 ntTSL 215.43■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 PRPF8-215ENST00000576958 416 ntTSL 211.42□□□□□ -0.585e-12■■■■■ 27
RPS3P23396 TPP1-204ENST00000524611 470 ntTSL 29.05□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TPP1-207ENST00000524924 289 ntTSL 37.91□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ESYT1-209ENST00000551112 548 ntTSL 37.22□□□□□ -1.252e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 BET1-206ENST00000457139 1357 ntTSL 37.17□□□□□ -1.262e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TPP1-214ENST00000532191 433 ntTSL 26.97□□□□□ -1.292e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 517.75■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 517.62■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 RABAC1-204ENST00000598057 662 nt17.26■□□□□ 0.355e-19■■■■■ 27
RPS3P23396 RABAC1-202ENST00000595226 725 ntTSL 217.03■□□□□ 0.325e-19■■■■■ 27
RPS3P23396 HSPA8-213ENST00000530391 648 ntTSL 319.56■□□□□ 0.721e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 HSPA8-204ENST00000524590 536 ntTSL 51.68□□□□□ -2.141e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 27
RPS3P23396 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 59.61□□□□□ -0.874e-9■■■■■ 27
RPS3P23396 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 58.5□□□□□ -1.054e-9■■■■■ 27
RPS3P23396 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 CLSTN3-202ENST00000331148 2288 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-220ENST00000607532 1877 ntTSL 319.18■□□□□ 0.662e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-208ENST00000421203 1544 ntTSL 218.95■□□□□ 0.622e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-213ENST00000452989 938 ntTSL 518.29■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-203ENST00000379291 693 ntTSL 518.14■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-209ENST00000422136 972 ntTSL 316.86■□□□□ 0.292e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-212ENST00000489099 1285 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-211ENST00000446018 762 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 27
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RPS3P23396 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 NSUN5-205ENST00000455763 471 ntTSL 415.82■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 PSMA3-206ENST00000554456 435 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-210ENST00000478138 504 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-214ENST00000606214 2229 ntAPPRIS P1 TSL 511.68□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-221ENST00000607658 1649 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.832e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-202ENST00000371092 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-218ENST00000607208 340 ntTSL 57.2□□□□□ -1.262e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-210ENST00000428109 832 ntTSL 35.65□□□□□ -1.52e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.562e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-203ENST00000460251 1012 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-207ENST00000420456 790 ntTSL 55.2□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-206ENST00000462285 657 ntTSL 24.43□□□□□ -1.72e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 TBC1D7-206ENST00000416436 714 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-213ENST00000489863 619 ntTSL 32.02□□□□□ -2.092e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-209ENST00000476508 945 ntTSL 32.02□□□□□ -2.092e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-204ENST00000460394 873 ntTSL 31.97□□□□□ -2.092e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ITGB3BP-208ENST00000465781 1025 ntTSL 31.24□□□□□ -2.212e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 ADH5-209ENST00000512604 331 ntTSL 30.88□□□□□ -2.272e-10■■■■■ 27
RPS3P23396 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 27.09□□□□□ -1.274e-34■■■■■ 27
RPS3P23396 ATP5A1-206ENST00000587902 571 ntTSL 29.35□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 27
RPS3P23396 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 ATP5G2-203ENST00000495596 1976 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.287e-9■■■■■ 26.9
RPS3P23396 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 26.9
RPS3P23396 CHERP-202ENST00000544299 1755 ntTSL 217.96■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 26.9
RPS3P23396 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 26.9
RPS3P23396 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 26.9
RPS3P23396 NARS-210ENST00000589314 1036 ntTSL 58.77□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 26.9
RPS3P23396 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 220.16■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.893e-7■■■■■ 26.9
RPS3P23396 CCT7-214ENST00000492253 531 ntTSL 46.58□□□□□ -1.366e-11■■■■■ 26.9
RPS3P23396 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 26.9
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