Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBA1P22314 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA1P22314 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA1P22314 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA1P22314 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA1P22314 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA1P22314 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA1P22314 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBA1P22314 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBA1P22314 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA1P22314 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA1P22314 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA1P22314 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA1P22314 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA1P22314 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms