Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK11BP21127 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms