Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4BPBP20851 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms