Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNA1P20827 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNA1P20827 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms