Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB1P20618 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms