Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PVALBP20472 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PVALBP20472 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PVALBP20472 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PVALBP20472 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PVALBP20472 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PVALBP20472 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms