Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB4AP20338 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms