Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PGCP20142 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PGCP20142 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PGCP20142 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PGCP20142 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PGCP20142 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGCP20142 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PGCP20142 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PGCP20142 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PGCP20142 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PGCP20142 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms