Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMY2BP19961 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AMY2BP19961 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms