Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCC1P18754 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCC1P18754 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCC1P18754 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCC1P18754 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RCC1P18754 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RCC1P18754 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RCC1P18754 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RCC1P18754 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RCC1P18754 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms