Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTPS1P17812 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTPS1P17812 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms