Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DESP17661 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DESP17661 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DESP17661 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DESP17661 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DESP17661 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DESP17661 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DESP17661 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DESP17661 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DESP17661 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DESP17661 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DESP17661 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms