Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL3L1P16619 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCL3L1P16619 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms