Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAV1P15498 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAV1P15498 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAV1P15498 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAV1P15498 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAV1P15498 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAV1P15498 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAV1P15498 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms