Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms