Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNT1P13805 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms