Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT13P13646 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT13P13646 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT13P13646 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT13P13646 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT13P13646 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT13P13646 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT13P13646 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT13P13646 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms