Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDH1P12830 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDH1P12830 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDH1P12830 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH1P12830 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH1P12830 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH1P12830 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDH1P12830 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms