Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ODC1P11926 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ODC1P11926 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ODC1P11926 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ODC1P11926 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODC1P11926 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ODC1P11926 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ODC1P11926 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODC1P11926 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ODC1P11926 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ODC1P11926 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ODC1P11926 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms