Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOP2AP11388 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOP2AP11388 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOP2AP11388 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms