Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNB1P11230 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms