Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARAP10276 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARAP10276 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARAP10276 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARAP10276 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RARAP10276 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARAP10276 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARAP10276 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARAP10276 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms