Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CSB-PGBD3P0DP91 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSB-PGBD3P0DP91 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms