Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXB7P09629 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXB7P09629 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXB7P09629 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms