Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PKHD1P08F94 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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