Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTSLP07711 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTSLP07711 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTSLP07711 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTSLP07711 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTSLP07711 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTSLP07711 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTSLP07711 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTSLP07711 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTSLP07711 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSLP07711 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSLP07711 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSLP07711 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSLP07711 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTSLP07711 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms