Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSN3P07498 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSN3P07498 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN3P07498 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN3P07498 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms