Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF1RP07333 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF1RP07333 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF1RP07333 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF1RP07333 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF1RP07333 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSF1RP07333 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSF1RP07333 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSF1RP07333 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms