Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms