Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB3P05106 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB3P05106 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms