Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRBV12-3P01733 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV12-3P01733 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms