Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGKV1-17P01599 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms