Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EGFRP00533 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EGFRP00533 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EGFRP00533 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EGFRP00533 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EGFRP00533 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EGFRP00533 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EGFRP00533 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms