Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MBD3O95983 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD3O95983 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD3O95983 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD3O95983 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MBD3O95983 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MBD3O95983 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MBD3O95983 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MBD3O95983 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MBD3O95983 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MBD3O95983 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms