Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSL3O95573 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSL3O95573 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms