Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC24AO95486 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC24AO95486 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms