Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5LO95447 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms