Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPINO95295 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNAPINO95295 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms