Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBOX1O75936 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBOX1O75936 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms