Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFPL2O75678 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFPL2O75678 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms