Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KA4O75676 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KA4O75676 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms