Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LGR5O75473 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGR5O75473 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LGR5O75473 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LGR5O75473 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LGR5O75473 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LGR5O75473 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LGR5O75473 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms