Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAP30O75446 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAP30O75446 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAP30O75446 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAP30O75446 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAP30O75446 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAP30O75446 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAP30O75446 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAP30O75446 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAP30O75446 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SAP30O75446 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAP30O75446 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms