Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF40AO75400 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF40AO75400 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms