Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PITX3O75364 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PITX3O75364 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PITX3O75364 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PITX3O75364 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PITX3O75364 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms