Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF40O75150 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF40O75150 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF40O75150 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF40O75150 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF40O75150 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF40O75150 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms