Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRIN3BO60391 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms