Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP104O60308 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP104O60308 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP104O60308 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP104O60308 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP104O60308 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP104O60308 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP104O60308 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP104O60308 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP104O60308 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP104O60308 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP104O60308 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP104O60308 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms