Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LANCL1O43813 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms